R jest popularnym językiem programowania, który specjalizuje się w obliczeniach statystycznych i wykresach. Jest on powszechnie stosowany przez specjalistów do tworzenia oprogramowania statystycznego i wykonywania analizy danych. Jedną z zalet R jest jego rozszerzalność. Społeczność R stale dodaje nowe niestandardowe pakiety, które można zastosować do zbierania danych statystycznych w różnych dziedzinach nauki.
W tym tutorialu będziemy instalować R i pokażemy, jak dodać pakiety z oficjalnej strony Comprehensive R Archive Network (CRAN).
Wymagania
- Serwer Ubuntu 16.04.
- Co najmniej 1 GB pamięci RAM.
- Użytkownik inny niż root z uprawnieniami sudo. Aby dowiedzieć się, jak to ustawić, przejdź do tutorialu Wstępna konfiguracja serwera z Ubuntu 16.04.
Gdy te warunki są spełnione, jesteś gotowy, aby rozpocząć.
Krok #1: Instalacja R
R to dynamiczny projekt, a najnowsza stabilna wersja nie zawsze jest dostępna z repozytoriów Ubuntu, więc zaczniemy dodając repozytorium zewnętrzny obsługiwany przez CRAN:
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported gpg: Total number processed: 1 gpg: imported: 1 (RSA: 1)
Gdy mamy zaufanego klucza w bazie danych każdego serwera możemy dodać repozytorium.
sudo add-apt-repository 'deb [arch=amd64,i386] https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/'
Musimy uruchomić update po to, aby uwzględnić pakiet z nowego repozytorium:
sudo apt-get update
. . . Get:6 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ InRelease [3,590 B] Get:7 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages [31.5 kB] . . .
Jeżeli wiersze powyżej pojawiają się na wyjściu z polecenia update, mamy pomyślnie dodany do repozytorium. Możemy być pewni, że nie będzie przypadkowo zainstalowana starsza wersja.
Teraz jesteśmy gotowi do zainstalowania R:
sudo apt-get install r-base
W chwili pisania tego tekstu, najnowsza stabilna wersja z CRAN jest 3.3.2, która jest wyświetlana po uruchomieniu R. Ponieważ planujemy zainstalować przykładowy pakiet dla siebie w systemie, zaczniemy R jako root użytkownik tak, że biblioteki będą dostępne dla wszystkich użytkowników automatycznie:
sudo -i R
R version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair" . . . Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. >
Potwierdza to, że R jest zainstalowany pomyślnie.
Krok #2: Instalacja pakietów R z CRAN
Jednym z powodów popularności R – to ogromna ilość dodatkowych pakietów i dodatków. Dla przykładu, będziemy instalować txtplot – biblioteka, która zawiera pakiet wykresów ASCII (obejmuje wsparcie dla obiektów punktowych, liniowych wykresów, histogramów, itp.).
install.packages('txtplot')
Jako część procesu instalacji, będziesz mieć możliwość wyboru CRAN lusterka do instalacji:
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
HTTPS CRAN mirror
1: 0-Cloud [https] 2: Algeria [https]
3: Australia (Melbourne) [https] 4: Australia (Perth) [https]
5: Austria [https] 6: Belgium (Ghent) [https]
7: Brazil (SP 1) [https] 8: Bulgaria [https]
9: Canada (MB) [https] 10: Chile [https]
11: China (Beijing 4) [https] 12: Colombia (Cali) [https]
13: Czech Republic [https] 14: Denmark [https]
15: France (Lyon 1) [https] 16: France (Lyon 2) [https]
17: France (Marseille) [https] 18: France (Paris 2) [https]
19: Germany (Falkenstein) [https] 20: Germany (Münster) [https]
21: Iceland [https] 22: Ireland [https]
23: Italy (Padua) [https] 24: Japan (Tokyo) [https]
25: Malaysia [https] 26: Mexico (Mexico City) [https]
27: New Zealand [https] 28: Norway [https]
29: Philippines [https] 30: Russia (Moscow) [https]
31: Serbia [https] 32: Spain (A Coruña) [https]
33: Spain (Madrid) [https] 34: Switzerland [https]
35: Taiwan (Chungli) [https] 36: Turkey (Denizli) [https]
37: UK (Bristol) [https] 38: UK (Cambridge) [https]
39: UK (London 1) [https] 40: USA (CA 1) [https]
41: USA (IA) [https] 42: USA (KS) [https]
43: USA (MI 1) [https] 44: USA (TN) [https]
45: USA (TX) [https] 46: USA (WA) [https]
47: (HTTP mirrors)
Selection: 1
W tym przykładzie wybraliśmy 0-Cloud, co utworzy połączenie do sieci dostarczania treści (cdn), obsługiwanej przez RStudio. Lusterko zostanie ustawione jako domyślne dla pozostałej części sesji. Po wyjściu z R i ponownego uruchomienia, zostaniesz poproszony o ponownym wybraniu CRAN lusterka.
Uwaga: Przed listą lusterek następujący wynik pokazał, gdzie pakiet był zainstalowany.
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) . . .
Ta ścieżka site-wide jest dostępna, ponieważ uruchomiliśmy R jako root i jest podana prawidłowa lokalizacja, aby pakiet był dostępny dla wszystkich użytkowników.
Po zakończeniu instalacji, możemy pobrać txtplot:
library('txtplot')
Jeśli na ekranie nie pojawiło się powiadomienie o błędzie, oznacza to, że biblioteka została pomyślnie załadowana. Spróbuj popracować z nią i zbudować prosty wykres z osią etykiet. Jako przykład są używane dane pakietu datasets, który zawiera prędkość i drogę hamowania pojazdów na podstawie danych z 1920 roku:
txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = "speed", ylab = "distance")
+----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
120 + * +
| |
d 100 + * +
i | * * |
s 80 + * * +
t | * * * * |
a 60 + * * * * * +
n | * * * * * |
c 40 + * * * * * * * +
e | * * * * * * * |
20 + * * * * * +
| * * * |
0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
5 10 15 20 25
speed
Jeśli jesteś zainteresowany, aby dowiedzieć się więcej na temat txtplot, skorzystaj z pomocy (txtplot).
Każdy wcześniej skompilowany pakiet można zainstalować z CRAN za pomocą install.packages(). Aby dowiedzieć się więcej o dostępnych pakietach, otwórz listę oficjalnych pakietów mirror, organizowanych według nazwy lub daty publikacji.
Wniosek
Gratulacje, język programowania R pomyślnie zainstalowany na serwerze.